Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms