Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0F3

Sumf1, Sulfatase-modifying factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumf1Q8R0F3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sumf1Q8R0F3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms