Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms