Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms