Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms