Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Fcho1Q8K285 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Fcho1Q8K285 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Fcho1Q8K285 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fcho1Q8K285 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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Fcho1Q8K285 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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Fcho1Q8K285 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Fcho1Q8K285 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Fcho1Q8K285 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Fcho1Q8K285 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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