Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ep400Q8CHI8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ep400Q8CHI8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ep400Q8CHI8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ep400Q8CHI8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ep400Q8CHI8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ep400Q8CHI8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ep400Q8CHI8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ep400Q8CHI8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ep400Q8CHI8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ep400Q8CHI8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ep400Q8CHI8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ep400Q8CHI8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ep400Q8CHI8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ep400Q8CHI8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ep400Q8CHI8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ep400Q8CHI8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ep400Q8CHI8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ep400Q8CHI8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ep400Q8CHI8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ep400Q8CHI8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ep400Q8CHI8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms