Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slfn5Q8CBA2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slfn5Q8CBA2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slfn5Q8CBA2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slfn5Q8CBA2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slfn5Q8CBA2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slfn5Q8CBA2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slfn5Q8CBA2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slfn5Q8CBA2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slfn5Q8CBA2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slfn5Q8CBA2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slfn5Q8CBA2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slfn5Q8CBA2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slfn5Q8CBA2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Slfn5Q8CBA2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slfn5Q8CBA2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Slfn5Q8CBA2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slfn5Q8CBA2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slfn5Q8CBA2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slfn5Q8CBA2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slfn5Q8CBA2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slfn5Q8CBA2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slfn5Q8CBA2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slfn5Q8CBA2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slfn5Q8CBA2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slfn5Q8CBA2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slfn5Q8CBA2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slfn5Q8CBA2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slfn5Q8CBA2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slfn5Q8CBA2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slfn5Q8CBA2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slfn5Q8CBA2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slfn5Q8CBA2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slfn5Q8CBA2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slfn5Q8CBA2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms