Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slx1bQ8BX32 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms