Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Snx17Q8BVL3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx17Q8BVL3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snx17Q8BVL3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snx17Q8BVL3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx17Q8BVL3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx17Q8BVL3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx17Q8BVL3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx17Q8BVL3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx17Q8BVL3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx17Q8BVL3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx17Q8BVL3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx17Q8BVL3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx17Q8BVL3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx17Q8BVL3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms