Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQN9

C030005K15Rik, RIKEN cDNA C030005K15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C030005K15RikQ8BQN9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C030005K15RikQ8BQN9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C030005K15RikQ8BQN9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms