Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF3

Me3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me3Q8BMF3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Me3Q8BMF3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Me3Q8BMF3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Me3Q8BMF3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Me3Q8BMF3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Me3Q8BMF3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Me3Q8BMF3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Me3Q8BMF3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Me3Q8BMF3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Me3Q8BMF3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Me3Q8BMF3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Me3Q8BMF3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Me3Q8BMF3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Me3Q8BMF3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms