Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV0

Spock3, Testican-3, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock3Q8BKV0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spock3Q8BKV0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Spock3Q8BKV0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Spock3Q8BKV0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Spock3Q8BKV0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spock3Q8BKV0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spock3Q8BKV0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spock3Q8BKV0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spock3Q8BKV0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spock3Q8BKV0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Spock3Q8BKV0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spock3Q8BKV0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spock3Q8BKV0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Spock3Q8BKV0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spock3Q8BKV0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spock3Q8BKV0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spock3Q8BKV0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms