Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Necab1Q8BG18 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Necab1Q8BG18 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms