Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc50Q810U5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms