Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ0

Aldh3b1, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b1Q80VQ0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Aldh3b1Q80VQ0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Aldh3b1Q80VQ0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Aldh3b1Q80VQ0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Aldh3b1Q80VQ0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Aldh3b1Q80VQ0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Aldh3b1Q80VQ0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Aldh3b1Q80VQ0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Aldh3b1Q80VQ0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Aldh3b1Q80VQ0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Aldh3b1Q80VQ0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms