Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC39.14■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
NischQ80TM9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC39.13■■■■□ 3.85
NischQ80TM9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
NischQ80TM9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
NischQ80TM9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
NischQ80TM9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
NischQ80TM9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
NischQ80TM9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
NischQ80TM9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
NischQ80TM9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
NischQ80TM9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
NischQ80TM9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC39.1■■■■□ 3.85
NischQ80TM9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
NischQ80TM9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
NischQ80TM9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
NischQ80TM9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
NischQ80TM9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
NischQ80TM9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC39.09■■■■□ 3.85
NischQ80TM9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
NischQ80TM9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
NischQ80TM9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
NischQ80TM9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
NischQ80TM9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
NischQ80TM9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.85
NischQ80TM9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
NischQ80TM9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
NischQ80TM9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
NischQ80TM9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
NischQ80TM9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
NischQ80TM9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
NischQ80TM9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
NischQ80TM9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
NischQ80TM9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
NischQ80TM9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
NischQ80TM9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
NischQ80TM9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
NischQ80TM9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
NischQ80TM9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
NischQ80TM9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
NischQ80TM9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
NischQ80TM9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
NischQ80TM9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
NischQ80TM9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
NischQ80TM9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
NischQ80TM9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
NischQ80TM9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
NischQ80TM9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
NischQ80TM9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
NischQ80TM9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
NischQ80TM9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
NischQ80TM9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
NischQ80TM9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
NischQ80TM9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
NischQ80TM9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.83
NischQ80TM9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
NischQ80TM9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
NischQ80TM9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC39■■■■□ 3.83
NischQ80TM9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC39■■■■□ 3.83
NischQ80TM9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC39■■■■□ 3.83
NischQ80TM9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
NischQ80TM9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
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