Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC1

Prrc2a, Protein PRRC2A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2aQ7TSC1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrc2aQ7TSC1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrc2aQ7TSC1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrc2aQ7TSC1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrc2aQ7TSC1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrc2aQ7TSC1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrc2aQ7TSC1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrc2aQ7TSC1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrc2aQ7TSC1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrc2aQ7TSC1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrc2aQ7TSC1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrc2aQ7TSC1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrc2aQ7TSC1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrc2aQ7TSC1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrc2aQ7TSC1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrc2aQ7TSC1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrc2aQ7TSC1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrc2aQ7TSC1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrc2aQ7TSC1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrc2aQ7TSC1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrc2aQ7TSC1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrc2aQ7TSC1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prrc2aQ7TSC1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prrc2aQ7TSC1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prrc2aQ7TSC1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prrc2aQ7TSC1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prrc2aQ7TSC1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prrc2aQ7TSC1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prrc2aQ7TSC1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Prrc2aQ7TSC1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prrc2aQ7TSC1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prrc2aQ7TSC1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prrc2aQ7TSC1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrc2aQ7TSC1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Prrc2aQ7TSC1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrc2aQ7TSC1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prrc2aQ7TSC1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrc2aQ7TSC1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrc2aQ7TSC1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrc2aQ7TSC1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrc2aQ7TSC1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prrc2aQ7TSC1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prrc2aQ7TSC1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrc2aQ7TSC1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prrc2aQ7TSC1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prrc2aQ7TSC1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrc2aQ7TSC1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrc2aQ7TSC1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms