Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trim17Q7TPM3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim17Q7TPM3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms