Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd3eapQ76KJ5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms