Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
SynmQ70IV5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SynmQ70IV5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms