Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms