Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

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Length 3,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Usp34Q6ZQ93 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Usp34Q6ZQ93 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Usp34Q6ZQ93 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp34Q6ZQ93 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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Usp34Q6ZQ93 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Usp34Q6ZQ93 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp34Q6ZQ93 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Usp34Q6ZQ93 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp34Q6ZQ93 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Usp34Q6ZQ93 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp34Q6ZQ93 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp34Q6ZQ93 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp34Q6ZQ93 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp34Q6ZQ93 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp34Q6ZQ93 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Usp34Q6ZQ93 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp34Q6ZQ93 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp34Q6ZQ93 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Usp34Q6ZQ93 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp34Q6ZQ93 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp34Q6ZQ93 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp34Q6ZQ93 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp34Q6ZQ93 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp34Q6ZQ93 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp34Q6ZQ93 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp34Q6ZQ93 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Usp34Q6ZQ93 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Usp34Q6ZQ93 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Usp34Q6ZQ93 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Usp34Q6ZQ93 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp34Q6ZQ93 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp34Q6ZQ93 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms