Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc82Q6PG04 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms