Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms