Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms