Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrimpolQ6P1E7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms