Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cdk13Q69ZA1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cdk13Q69ZA1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdk13Q69ZA1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdk13Q69ZA1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdk13Q69ZA1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdk13Q69ZA1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdk13Q69ZA1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdk13Q69ZA1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdk13Q69ZA1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdk13Q69ZA1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdk13Q69ZA1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdk13Q69ZA1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdk13Q69ZA1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdk13Q69ZA1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdk13Q69ZA1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdk13Q69ZA1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdk13Q69ZA1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdk13Q69ZA1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdk13Q69ZA1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdk13Q69ZA1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdk13Q69ZA1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdk13Q69ZA1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdk13Q69ZA1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cdk13Q69ZA1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk13Q69ZA1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms