Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms