Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD7

Fnip1, Folliculin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnip1Q68FD7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fnip1Q68FD7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fnip1Q68FD7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fnip1Q68FD7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fnip1Q68FD7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fnip1Q68FD7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fnip1Q68FD7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fnip1Q68FD7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fnip1Q68FD7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fnip1Q68FD7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fnip1Q68FD7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fnip1Q68FD7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fnip1Q68FD7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fnip1Q68FD7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fnip1Q68FD7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fnip1Q68FD7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fnip1Q68FD7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms