Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifit1Q64282 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifit1Q64282 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifit1Q64282 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ifit1Q64282 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifit1Q64282 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ifit1Q64282 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifit1Q64282 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifit1Q64282 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifit1Q64282 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifit1Q64282 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ifit1Q64282 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ifit1Q64282 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ifit1Q64282 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ifit1Q64282 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ifit1Q64282 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ifit1Q64282 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ifit1Q64282 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifit1Q64282 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifit1Q64282 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifit1Q64282 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifit1Q64282 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifit1Q64282 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifit1Q64282 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifit1Q64282 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifit1Q64282 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifit1Q64282 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifit1Q64282 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
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