Protein–RNA interactions for Protein: Q64253

Ly6e, Lymphocyte antigen 6E, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6eQ64253 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ly6eQ64253 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6eQ64253 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms