Protein–RNA interactions for Protein: Q641K1

Agtpbp1, Cytosolic carboxypeptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Agtpbp1Q641K1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Agtpbp1Q641K1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Agtpbp1Q641K1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Agtpbp1Q641K1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Agtpbp1Q641K1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Agtpbp1Q641K1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Agtpbp1Q641K1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Agtpbp1Q641K1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Agtpbp1Q641K1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Agtpbp1Q641K1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Agtpbp1Q641K1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Agtpbp1Q641K1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Agtpbp1Q641K1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Agtpbp1Q641K1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Agtpbp1Q641K1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Agtpbp1Q641K1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Agtpbp1Q641K1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Agtpbp1Q641K1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Agtpbp1Q641K1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Agtpbp1Q641K1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Agtpbp1Q641K1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Agtpbp1Q641K1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Agtpbp1Q641K1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Agtpbp1Q641K1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Agtpbp1Q641K1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Agtpbp1Q641K1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Agtpbp1Q641K1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Agtpbp1Q641K1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Agtpbp1Q641K1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Agtpbp1Q641K1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Agtpbp1Q641K1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Agtpbp1Q641K1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Agtpbp1Q641K1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Agtpbp1Q641K1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Agtpbp1Q641K1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Agtpbp1Q641K1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms