Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col4a5Q63ZW6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms