Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CochQ62507 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CochQ62507 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CochQ62507 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CochQ62507 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CochQ62507 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CochQ62507 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CochQ62507 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CochQ62507 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CochQ62507 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CochQ62507 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CochQ62507 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CochQ62507 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CochQ62507 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CochQ62507 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CochQ62507 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CochQ62507 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CochQ62507 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CochQ62507 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CochQ62507 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CochQ62507 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CochQ62507 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CochQ62507 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CochQ62507 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CochQ62507 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CochQ62507 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CochQ62507 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CochQ62507 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CochQ62507 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CochQ62507 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CochQ62507 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CochQ62507 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CochQ62507 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CochQ62507 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CochQ62507 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CochQ62507 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CochQ62507 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CochQ62507 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CochQ62507 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CochQ62507 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CochQ62507 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CochQ62507 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CochQ62507 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CochQ62507 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CochQ62507 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CochQ62507 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CochQ62507 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CochQ62507 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CochQ62507 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CochQ62507 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CochQ62507 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CochQ62507 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CochQ62507 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CochQ62507 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CochQ62507 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CochQ62507 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CochQ62507 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CochQ62507 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CochQ62507 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CochQ62507 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CochQ62507 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CochQ62507 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CochQ62507 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CochQ62507 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CochQ62507 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CochQ62507 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CochQ62507 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CochQ62507 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CochQ62507 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CochQ62507 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CochQ62507 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CochQ62507 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CochQ62507 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CochQ62507 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CochQ62507 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CochQ62507 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CochQ62507 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CochQ62507 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CochQ62507 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CochQ62507 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CochQ62507 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CochQ62507 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CochQ62507 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CochQ62507 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CochQ62507 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CochQ62507 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CochQ62507 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CochQ62507 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CochQ62507 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CochQ62507 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CochQ62507 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CochQ62507 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CochQ62507 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CochQ62507 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CochQ62507 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CochQ62507 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CochQ62507 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CochQ62507 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CochQ62507 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CochQ62507 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms