Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms