Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rbm38Q62176 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rbm38Q62176 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rbm38Q62176 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rbm38Q62176 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rbm38Q62176 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Rbm38Q62176 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm38Q62176 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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