Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gli3Q61602 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms