Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itm2aQ61500 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms