Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms