Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd53Q61451 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd53Q61451 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd53Q61451 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd53Q61451 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd53Q61451 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd53Q61451 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd53Q61451 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd53Q61451 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd53Q61451 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd53Q61451 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd53Q61451 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd53Q61451 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd53Q61451 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd53Q61451 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd53Q61451 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd53Q61451 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd53Q61451 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd53Q61451 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd53Q61451 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd53Q61451 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd53Q61451 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd53Q61451 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd53Q61451 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd53Q61451 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd53Q61451 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd53Q61451 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd53Q61451 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd53Q61451 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd53Q61451 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd53Q61451 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd53Q61451 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd53Q61451 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms