Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms