Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms