Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms