Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms