Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms