Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms