Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdcp1Q5U462 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdcp1Q5U462 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdcp1Q5U462 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdcp1Q5U462 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdcp1Q5U462 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdcp1Q5U462 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdcp1Q5U462 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdcp1Q5U462 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdcp1Q5U462 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdcp1Q5U462 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdcp1Q5U462 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdcp1Q5U462 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdcp1Q5U462 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdcp1Q5U462 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdcp1Q5U462 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdcp1Q5U462 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdcp1Q5U462 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdcp1Q5U462 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdcp1Q5U462 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdcp1Q5U462 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdcp1Q5U462 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdcp1Q5U462 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdcp1Q5U462 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdcp1Q5U462 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdcp1Q5U462 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdcp1Q5U462 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdcp1Q5U462 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdcp1Q5U462 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdcp1Q5U462 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdcp1Q5U462 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdcp1Q5U462 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdcp1Q5U462 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdcp1Q5U462 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdcp1Q5U462 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdcp1Q5U462 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms