Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rabl6Q5U3K5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rabl6Q5U3K5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rabl6Q5U3K5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rabl6Q5U3K5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rabl6Q5U3K5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rabl6Q5U3K5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rabl6Q5U3K5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rabl6Q5U3K5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rabl6Q5U3K5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rabl6Q5U3K5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rabl6Q5U3K5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl6Q5U3K5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl6Q5U3K5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl6Q5U3K5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl6Q5U3K5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl6Q5U3K5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl6Q5U3K5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl6Q5U3K5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl6Q5U3K5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl6Q5U3K5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl6Q5U3K5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl6Q5U3K5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl6Q5U3K5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl6Q5U3K5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rabl6Q5U3K5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rabl6Q5U3K5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rabl6Q5U3K5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rabl6Q5U3K5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rabl6Q5U3K5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rabl6Q5U3K5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rabl6Q5U3K5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rabl6Q5U3K5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rabl6Q5U3K5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rabl6Q5U3K5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rabl6Q5U3K5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rabl6Q5U3K5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms