Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms